Дисковые файловые системы обычно являются поток-ориентированными. Файлы в поток-ориентированых файловых системах представляются последовательностью битов, часто предоставляющие такие функции, как чтение, запись, изменение данных и произвольный доступ.

ADFS — Advanced Disc Filing System. Разработна Acorn Computers, является преемником DFS.
AdvFS — Advanced File System, создана в Digital Equipment Corporation для Digital UNIX/Tru64 UNIX операционной системы.
AFS (не путать с Andrew File System, далее) — Acer Fast Filesystem, используется в SCO OpenServer.

Ami File Safe — Ami File Safe, коммерческая ФС, поставлялась вместе с Amiga в 90х годах. Структурно совместима с PFS.
FFS (Amiga) (англ.) (не путать с Berkley Fast File System) — Fast File System, используется в ОС семейства AmigaOS (также поддерживается ОС MorphOS). На данный момент считается устаревшей. Имеет расширения FFS1, FFS Intl, FFS DCache, FFS2.
AthFS (англ.) — AtheOS File System, 64-битная журналируемая файловая система, сейчас используется в ОС Syllable. Также известная, как AFS.

BeFS (BFS) — Be File System, используется в ОС BeOS
Btrfs — Файловая система, основанная на структурах двоичных деревьев (B-Tree), созданная Oracle Corporation в 2007 году.
CBMFS — Использовалась на большинстве Commodore 64 совместимых флоппи-дисководах.
CMDFS — Расширение файловой системы CMBFS добавленное Creative Micro Designs для использования своих 3.5" флоппи дисководов, RAM дисков и контроллеров жестких дисков.
Cramfs — Compressed ROM file system
CSI-DOS — Использовалась на БК в операционной системе CSI-DOS
DTFS — Desktop File System, специализирующаяся на сжатии, используется в SCO OpenServer
EAFS — Extended Acer Fast Filesystem, обычно используется для хранения начального загрузчика и ядра в семействе UNIX‐овых ОС SCO OpenServer. Обычно монтируется как /boot.
EFS (IRIX) (англ.) — Устаревшая поблочная система для ОС IRIX.
EFS — Encrypted filesystem, это расширение для NTFS
Ext — Расширенная файловая система, разработанная для ОС на ядре Linux
ext2 — Второе расширение файловой системы
ext3 — Журналируемая версия ext2.
ext3cow — Версия ext3 с поддержкой снапшотов.
ext4 — Новая версия файловой системы ext3, с поддержкой экстентов.
Next3 — ФС для Linux с поддержкой снапшотов, разработанная CTERA Networks. Базируется на коде ext3. Исходные коды проекта распространяются под лицензией GNU GPL.
FAT — Используется в DOS и Microsoft Windows. Различается размером таблиц (12, 16 и 32 бит).
FATX (англ.) — Модифицированная версия FAT, используется в оригинальных Xbox игровых консолях.
GCR — Group Code Recording, формат хранения данных на 5¼″ дискетах, использовавшихся 8‐ми битными Apple II и Commodore Business Machines.
Fossil(англ.) — Архивная файловая система от Plan 9 Bell Labs.
Files-11 — Файловая система для ОС OpenVMS
HFS — Hierarchical File System, использовалась в старых версиях ОС семейства Mac OS
HFS Plus — Обновлённая версия HFS, используемая в последних версиях ОС семейства Mac OS
HPFS — High Performance Filesystem, используется в ОС OS/2
HTFS (англ.) — High Throughput Filesystem, файловая система ОС SCO OpenServer 5.
ISO 9660 — Используется на CD-ROM и DVD дисках. Имеет расширения Rock Ridge и Joliet.
JFS — Журналируемая файловая система, созданная IBM, существует для ОС на ядре Linux, OS/2, и AIX, поддерживает экстенты.
LFS (англ.) — Файловая система структурированных логов.
Macintosh File System (англ.) (MFS) — Файловая система, когда-то использовшаяся в ранних ОС семейства Mac OS
Minix — Использовалась в ОС Minix
MUFS — Multiuser Filesystem, расширение для файловых систем AmigaOS, позволяющее реализовать пользовательские права
NetWare File System (англ.) — Оригинальная ФС для NetWare 2.x — 5.x, используемая опционально в следующих версиях.
NILFS — Linux версия LFS.
NTFS — Используемая в линейке ОС Microsoft Windows NT журналируемая файловая система.
OFS — Old File System, для AmigaOS. Используется в основном для дискет.
PFS — а также PFS2, PFS3, и т. п. развитая файловая система, доступная для ОС семейства AmigaOS и обладающая высокой надёжностью.
Qnx4fs — Файловая система, используемая в QNX версиях 4 и 6.
Qnx6fs — Новая copy-on-write файловая система, представленная в QNX 6.4.0 и используемая как основная начиная с 6.4.1.
ReiserFS — Файловая система, разработанная специально для Linux и способная к журналированию.
Reiser4 — 4-я версия файловой системы ReiserFS.
S51K — AT&T UNIX System V 1KB файловая система, используется в SCO OpenServer.
SkyFS — Файловая система разрабатываемая проектом SkyOS для замены используемой в текущий момент BFS от BeOS
SpadFS — Нежурналируемая файловая система, с возможностью просмотра хэша реализована под Linux.
Standard Language File System (STL) — файловая система созданная в IBM.
Tivo's Media File System (англ.) — Патентованный, стойкий к ошибкам формат, используемый в Tivo жестких дисках для записи телевизионных передач.
Tux3 (англ.) (tux3fs) — Экспериментальная свободная файловая система для Linux.
Unix File System (UFS), так же называемая Berkeley Fast File System или BSD Fast File System (FFS) — стандартная система, разработанная в Беркли и использовавшаяся в старых ОС семейства BSD
Unix File System 2 (UFS2) — используется в последних версиях ОС семейства BSD
UDF — Пакетная файловая система для устройств WORM/RW (таких как CD-RW и DVD).
VxFS — Файловая система, созданная Veritas, первая коммерческая журналируемая файловая система; HP-UX, Solaris, Linux, AIX
VSAM — Транзакционная файловая система, манипулирующая виртуальным хранилищем данных
WinFS — Windows Future Storage, планируется как замена для NTFS. На данный момент существует только в бета версии и используется внутри компании Microsoft.
WAFL — Внутренняя высокопроизводительная файловая система, используемая в специализированной ОС Data ONTAP в сетевых система хранения данных от фирмы NetApp.
XFS — Используется в ОС IRIX, GNU/Linux и BSD
ZFS — Zettabyte filesystem, открытая файловая система от Sun Microsystems. Используется в ОС Solaris 10, Solaris Express Developer Edition, FreeBSD, Mac OS X Leopard, Linux (в userland).
ФС БК-11 — Использовалась на БК в ОС БК-11.

Файловые системы для флеш-дисков / твердотельных носителей

FAT — исходно дисковая файловая система — теперь часто используется на флеш-дисках. Имеет ограничение на размер файла в 4 гигабайта.
exFAT — Расширенная версия FAT, используемая для флеш-дисков. Запатентована Microsoft, часто называется как FAT64 — ограничение 264 байт (16 эксабайт).
TFAT (англ.) — Транзакционная версия FAT файловой системы.
FFS2 — Продолжение файловой системы FFS1, Одна из ранних файловых систем для флеш-карт. Разработана и запатентована Microsoft в начале 1990х годов. U.S. Patent 5392427 (англ.)
JFFS — Оригинальная лог-структурированная Linux файловая система для NOR-флеш-носителей.
JFFS2 — Продолжение JFFS для NAND- и NOR-флеш-носителей.
LogFS — Предназначена для замены JFFS2, лучшая расширяемость. Находится на ранней стадии разработки.
Non-Volatile File System — файловая система для флеш-дисков, разработанная Palm, Inc..
YAFFS — Лог структурированная файловая система, предназначенная для NAND-флеш, но может использоваться в NOR-флеш-дисках.

Запись-ориентированные файловые системы

Files-11 — Ранняя версия была запись-ориентированной; поддержка потоков была добавлена позднее.
Virtual storage access method (VSAM) — Использовалась в System/370 и MVS
Structured File Server (SFS) — Запись-ориентированная файловая система от IBM, оригинальная часть системы Encina, теперь интегрирована в CICS.
RSD (record sequential delimited) — (разделенная последовательность записей) — Запись ориентированная файловая система от IBM.

Файловые системы для сетевых хранилищ

                Могут быть симметричными, когда метаданные распределены между узлами, или асимметричными — с централизованными хранилищами метаданных.

CXFS (XFS для кластера) — Файловая система расширяющая XFS для использования в сети имеющей SGI-сервера. Сфера применения типична для решений Silicon Graphics — видеомонтаж, обработка массивов видеоматериалов.
EMC Celerra HighRoad от компании EMC. Доступна для ОС AIX, HP-UX, IRIX, Solaris и Windows. Асимметрична.
IBM SAN File System (англ.) — распределённая файловая система, разработанная IBM
Files-11 — Файловая система для кластеров VMS, выпущена DEC в 1983, ныне компания HP. Симметрична.
Global File System (GFS) — Компания Red Hat. Выпущена в Linux под лицензией GNU GPL. Симметрична (GDLM) и асимметрична (GULM).
HP Cluster File System (CFS) (TruCluster) — компания HP. Доступна для Tru64 UNIX.
Melio FS — Компания Sanbolic. Доступна для Windows. Симметрична.
Nasan — Файловая система от компании DataPlow. Доступна в Linux и Solaris. Асимметрична.
OCFS — Oracle Cluster File System, Кластерная файловая система от Oracle. Лицензия GNU GPL. Симметрична
PolyServe file system (PSFS) — Компания PolyServe — используется в их PolyServe Matrix Server, который фокусируется на экспортировании клиентам через CIFS или NFS, также как и Microsoft SQL Server и Oracle 9i RAC и 10g. Доступна в Linux и Windows. Симметрична.
Veritas Storage Foundation Cluster File System (CFS) — Разработана компанией Symantec. Доступна в AIX, HP-UX, Linux и Solaris. Асимметрична.
Xsan — Кластерная файловая система созданная компанией Apple Computer, Inc. Асимметрична, доступна в Mac OS. Совместима с StorNext File System.
VMFS — Разработана VMware/EMC Corporation. Доступна в VMware ESX Server. Симметрична.

Распределенные файловые системы

Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) — онлайновая веб-служба, предлагаемая Amazon Web Services, предоставляющая возможность для хранения и получения любого объёма данных, в любое время из любой точки сети, так называемый файловый хостинг.
Andrew file system (AFS) — масштабируемая и независимая от расположения ФС, имеет сильный кэш-клиент и использует Kerberos для авторизации.               
       Различные внедрения используют оригинальные части от IBM (ранее Transarc), Arla и OpenAFS.

Arla — Свободно распространяемые сервер и клиент с поддержкой AFS
Apple Filing Protocol (AFP) — ФС от Apple Computer. AFP может использовать протокол Kerberos для авторизации.
CIFS — Распределённая ФС, основанная на SMB с поддержкой UNIX-прав и блокировок, при этом использующая DNS имена машин, а не NetBIOS, в отличие от SMB.
DCE Distributed File System (DCE/DFS) — ФС от IBM (ранее Transarc) похожа на AFS и полностью соответствует стандарту POSIX и стандартам систем высокой доступности. Доступна для ОС AIX и Solaris под запатентованной лицензией.
NetWare Core Protocol (NCP) — ФС от Novell. Используется в сетях, основанных на NetWare.
Network File System (NFS) изначально от Sun Microsystems, теперь является стандартом в UNIX-подобных сетях. NFS может использовать протокол Kerberos для авторизации и кэш клиента.
RFS (Remote File Sharing — совместное использование удаленных файлов) — сетевая файловая система только для UNIX System V, начиная с Release 3. Использует протокол интерфейса транспортного уровня TLI.
OneFS (англ.) - One File System, полностью журналируемая, распределённая ФС, разработанная Isilon Systems. Позволяет хранить более 150 Тбайт данных.
OpenAFS — Открытая реализация распределенной файловой системы AFS.
Self-certifying File System (SFS), Глобальная сетевая файловая система, разработанная для безопасного доступа к файлам через различные административные домены.
v9fs — Распределённая файловая система для ОС Plan 9 и Inferno.

Распределенные параллельные файловые системы с защитой от сбоев

                Все здесь перечисленные файловые системы фокусируются на высокой доступности, масштабируемости и высокой производительности, если не указано иначе.

Coda (англ.) — ФС, созданная в Carnegie Mellon University и нацеленная на операции, адаптируемые к пропускной способности канала (включая операции в режиме off-line). Использует кэш на стороне клиента для мобильных компьютеров. Данная ФС является потомком AFS-2 и доступна для Linux под лицензией GNU GPL.

dCache — ФС от компаний Fermilab и DESY. Является бесплатным ПО (однако не относится к свободному программному обеспечению из-за лицензионных ограничений).
ExaFS — Распределенная ФС от Exanet. Идет как часть ExaStore, основанном на Linux NAS решении запущенном на оборудовании Intel, обслуживает NFS v2/v3, SMB/CIFS и AFP для Microsoft Windows, Mac Os, Linux и других UNIX клиентов. Доступна под патентованной лицензией.
Gfarm — ФС, использующая OpenLDAP или PostgreSQL для метаданных и FUSE или LUFS для монтирования. Доступна в Linux, FreeBSD, NetBSD и Solaris под лицензией X11.
GlusterFS — Настраиваемая, высоко производительная кластерная ФС, распространяемая как часть GNU Clustering Platform. Доступна для любой POSIX совместимой операционной системы, под лицензией GNU GPL.
GPFS — General Parallel File System, виртуальная файловая система для параллельной обработки данных разработанная IBM. Поддерживает репликацию между подсоединенными блочными устройствами хранения. Доступна в AIX, Linux и Windows. Синхронная или асинхронная репликация (настраиваемо).
Google File System — Кластерная ФС, оптимизированная для работы с большими блоками данных по 64 Мб, а также обладающая повышенной защитой от сбоев. Вся информация копируется и хранится в трех местах одновременно, при этом система способна очень быстро находить реплицированные копии, если какая-то машина вышла из строя. Задачи автоматического восстановления после сбоя решаются с помощью программ, созданных по модели MapReduce. Является коммерческой тайной компании Google. Доступна только через Google App Engine.
IBRIX Fusion — Программный пакет Fusion Software Suite, реализующий кластерную файловую систему Segmented File System. Создана компанией IBRIX. Доступна в Linux под патентованной лицензией.
Lustre — Предназначена для использования в больших Linux-кластерах (от 1000 машин) Используется на многих самых производительных кластерах в мире. Лицензия GNU GPL.
MogileFS — Распределенная ФС, созданная в рамках проекта LiveJournal и реализованная на уровне многоплатформенного приложения на Perl. Не совместима со стандартом POSIX, использует плоское пространство имен, уровень приложений, MySQL для метаданных и протокол HTTP для транспорта. Разработана компанией Danga Interactive. Доступна в Linux под лицензией GPL.
OneFS distributed file system — Компания Isilon. Основанная на ОС BSD на выделенном Intel оборудовании, обслуживает NFS v3 и SMV/CIFS для Windows, Mac OS, Linux и других UNIX клиентов, доступна под патентованной лицензией.
Panasas ActiveScale File System (PanFS) — Компания Panasas — использует объектные устройства хранения. Доступна в Linux под патентованной лицензией.
PeerFS — Radiant Data Corporation — Фокусируется на высокой доступности и высокой производительности, использует репликацию типа точка-точка с множественными источниками и целями. Доступна в Linux под патентованной лицензией.
POHMELFS (Parallel Optimized Host Message Exchange Layered File System) — кэш-согласованная распределенная файловая система, может рассматриваться как более быстрая и изящная замена широко распространенного протокола сетевого доступа к файловым системам Network File System (NFS). 9 июня 2009 года поддержка POHMELFS была включена в версию ядра Linux 2.6.30.
Tahoe — данные дублируются, шифруются, поддерживается контроль доступа, написана на Python под GPLv2
TerraGrid Cluster File System — Terrascale Technologies Inc — Реализует связанность кэша под запросу и использует стандарт iSCSI и модифицированную версию файловой системы XFS. Доступна в Linux под патентованной лицензией.

zFS, от компании IBM (не путать с ZFS от Sun Microsystems) фокусируется на кооперативном КЭШе и распределенных транзакциях, использует объектные устройства хранения. Находится в разработке и на данный момент недоступна.
Hadoop Distributed File System — Бесплатный клон GoogleFS
Kosmos Distributed File System — ФС, разработанная Kosmix, теперь является свободным ПО.
HAMMER/ANVIL от Matt Dillon
OASIS от ETRI. Весьма схожа с Lustre или Panasas. Доступна в Linux через специальную программу переноса программ, предоставленную ETRI.
Parallax
XtreemFS — Бесплатная открытая параллельная, объектно-ориентированная файловая система. Разработана как часть XtreemOS, полностью интегрирована с управлением Virtual organization (VO).

Файловые системы точка-точка

CFS — Файловая система только для чтения, основанная на распределенной таблице хэшей Chord DHT.
Cleversafe Используется Cauchy Reed-Solomon Information Dispersal Algorithms — Дисперсионные информационные алгоритмы — (IDAs) для разделения данных в неопределимых срезах и распространения их через безопасные соединения через Internet на множественные места хранения.
Infinit — Это широко масштабируемая файловая система точка-точка, разработанная в C++, дает пользователям надежное и безопасное хранение их файлов пространственно-независимым и реплицируемым путем. Позволяет делиться файлами с контролируемым набором пользователей, друзей и т. д.
Ivy — Файловая система чтения/записи основанная на логах, отсюда невозможность масштабирования с большим количеством пользователей.
Pastis — французская файловая система точка-точка, разработанная на Java.

Файловые системы специального назначения

AppleShare — Сетевая файловая система в ранних версиях Mac OS
archfs — Архивирующая файловая система
cdfs — Система поддержки чтения и записи CD
cfs — Кэширующая файловая система
Coda — Файловая система с поддержкой автономной работы, происходит из OpenAFS.
compFUSEd (оверлей прозрачного сжатия — чтение/запись, основан на FUSE)
Cramfs — Compressed ROM file system, свободная сжатая файловая система для GNU/Linux для встраиваемых систем основанных на ПЗУ.
Cromfs — Работающая в пользовательском пространстве (FUSE) файловая система только для чтения использующая эффективность LZMA алгоритма сжатия.
Datalight Reliance — Транзакционная файловая система для 32 битных встроенных систем от Datalight.
Davfs2 — Расширение файловой системы WebDAV
DFS — Распределённая (сетевая) файловая система для ОС семейства Microsoft Windows
FDI — Файловая система разработанная Intel для Flash носителей. Используется, в частности, в сотовых телефонах марки Motorola.
ftpfs — Файловая система, используемая при доступе по протоколу ftp
fuse — Файловая система пользователя, аналогична lufs но имеет лучшую архитектуру.
FuseCompress — Основана на FUSE, предоставляет прозрачное сжатие данных.
GmailFS — (Google Mail File System) — Файловая система Google для своей почтовой системы GMail.
HDFS — Распределенная файловая система, являющаяся частью проекта Apache Hadoop.
InterMezzo — Является преемником Coda, поддерживает синхронизацию с сервером и кэширование файлов.
Kimberlite — Система позволяющая подключить две машины под ОС GNU/Linux к одному SCSI-накопителю.
lnfs — Система поддержки длинных имён
LUFS — Система для доступа по протоколам ftpfs, ftp ssh

MapFS — Распределённая файловая система компании Levanta. Позволяет монтировать группе машин удаленную файловую систему доступную в режиме только для чтения, но дающую возможность модификации файлов, при этом изменения произведенные на каждой машине сохраняются локально. Лицензия GNU GPL.

MelioFS — Распределённая файловая система компании Sanbolic. Позволяет множеству машин одновременно работать на чтение и на запись не только с одним томом, а даже с одним файлом. Поддерживается множество родных возможностей по работе с файловыми системами MS Windows.
mini fo (The mini fanout overlay file system) — Перенаправляет модифицированные операции в записываемое пространство названное директориях хранения, оставляет оригинальные данные в основной директории незатронутыми. При считывании, файловая система смешивает модифицированные данными и оригинальные, так чтобы только наиболее новая версия была показана.

MVFS — MultiVersion File System — Мультиверсионная файловая система, пропиеритарная, используется Rational ClearCase.
NCUFS — The NetWare UNIX Client File System (NUCFS), сетевая файловая система от SCO, используется для подключения UNIX-клиентов к файловым ресурсам серверов Novell NetWare.
nntpfs — Система поддерживающая протокол netnews
NOOFS — Сетевая файловая система, использующая в качестве хранилища данных SQL-базу, в частности PostgreSQL.
ParFiSys — Экспериментальная файловая система для параллельной обработки данных
plumber (Plan 9) — Система обмена сообщениями между работающими процессами, иначе реализация механизма «многопоточности»

PVFS — Распределенная файловая система, заменяющая NFS для кластера. Состоит из централизованного сервера метаданных и множества демонов ввода/вывода, непосредственно занимающихся отдачей и сохранением информации. Данные хранятся на специально отведенных нодах кластера, возможности резервирования пока отсутствуют.

ramfs — Система используемая для создания RAM-диска в процессе загрузки ОС семейства BSD и на ядре Linux
romfs — (ROM filesystem) — Чрезвычайно простая файловая система, без многих функций, предназначена для записи важных файлов в EEPROM. Доступна в Linux, и возможно в других UNIX-похожих системах.
Squashfs — Система компрессирующая данные с атрибутом «только для чтения»
tmpfs — Файловая система поддерживающая работу с виртуальной памятью.
UMSDOS — Файловая система подобная FAT, но расширенная для хранения прав доступа и метаданных, используется в ОС на ядре Linux.
UnionFS — Каскадно-объединенная файловая система, которая может смешивать содержимое различных директорий (ветви), оставляя содержимое физически разделенным.
WDK.VFS — SiteAdmin CMS — Виртуальная файловая система, представлена Evgenios Skitsanos.
wikifs — Файловая система, используемая Википедией
Barracuda WebDAV plugin — безопасный сетевой файловый сервер для встроенных устройств.
SODA: a Lease-based Consistent Distributed File System — ранние 1990-е годы.
SysmanFS (Основана на FUSE), виртуальная файловая система для управления кластерами.
pramfs — Защищенная и постоянная файловая система для RAM-устройств.
ERTFS ProPlus64 — идёт с интегрированной операцией защиты от сбоев, по умолчанию работает в журналируемом режиме.
Callback File System — виртуальная файловая система для Windows.
Owner-Free Filesystem — распределённая файловая система, в которой никакой файл не хранится целиком на единственном компьютере.

Псевдо- и виртуальные файловые системы

devfs — Устаревшая система файловых устройств в ОС семейств BSD, GNU/Linux.
procfs — Система для обслуживания процессов, устаревший механизм ОС семейств BSD, GNU/Linux.
specfs — Специальная файловая система для файловых устройств.
sysfs — Получение информации о системных устройствах и драйверах в GNU/Linux.
CrossDOS — Промежуточная файловая система для переноса данных между другими файловыми системами в AmigaOS.
vmfs — файловая система фирмы VMWare ESX/

Шифрованные файловые системы

eCryptfs — Криптографическая файловая система в ядре Linux начиная с версии 2.6.19
EncFS, GPL Encrypted filesystem (Шифрованная файловая система) — в пользовательском пространстве.
EFS (Encrypted file system, Шифрованная файловая система) — для Microsoft Windows систем. Является расширением файловой системы NTFS, использует сертификаты шифрования.
FSFS — Fast Secure File System — Быстрая Безопасная Файловая Система
PhoneBookFS - для телефонов
Rubberhose filesystem
Solid File System (SolFS) — кроссплатформенная однофайловая виртуальная файловая система с шифрованием и сжатием.
Secure Shell File System (SSHFS) — позволяет локально монтировать директорию с удаленного сервера, используя только учетные данные secure shell .
ZFS — Поддержка шифрования в файловой системе ZFS.

Файловые системы с защитой от сбоев

RAIF Redundant Array of Independent Filesystems — Избыточный Массив Независимых Файловых систем — файловая система похожая на структуру RAID.
ZFS Содержит свое внедрение RAID-5 и RAID-6 — RAID-Z и RAID-Z2 соответственно.